克里斯托弗·马蒂亚斯·穆勒毕业于辛辛那提大学，音乐硕士，先后与小泽征尔、莱昂·弗莱舍等大师一起工作过。
2001年，指挥大师克劳迪奥·阿巴多任命穆勒为著名的古斯塔夫·马勒青年交响乐团的助理指挥，随后也将他作为自己在琉森节日交响乐团的副指挥。
2005年起，克里斯托弗·马蒂亚斯·穆勒担任德国哥廷根交响乐团首席指挥，一再地和令人印象深刻地证明了他在工作中的非凡品质。在他的指导下，乐团已成为德国杰出的乐团。
2010年起，克里斯托弗·马蒂亚斯·穆勒担任莫斯科大剧院的客座指挥，首次亮相执棒的作品是约翰·施特劳斯轻歌剧《蝙蝠》，稍后执棒了理查·施特劳斯的代表作《玫瑰骑士》。
2014年，他在莫斯科大剧院重新演绎了克劳德·德彪西的两部歌剧作品，引起了媒体的广泛关注和赞誉，并在德国国家广播电台文化频道多次播出。
2017年，克里斯托弗·马蒂亚斯·穆勒带领乐团第二次摘取了欧洲著名的ECHO 古典音乐大奖。
当代音乐也是克里斯托弗·马蒂亚斯·穆勒关注的重要领域：现代作曲家鲁道夫·克尔特博恩、伊莎贝尔·蒙德里、热拉尔·辛斯塔格等，先后将自己的作品委托穆勒完成世界首演。